Fylogeneze je obor, který v biologie věnuje se výhradně studiu a poznávání původu, odkud pocházejí a vývoji různých druhů, které osídlují naši planetu, a totéž činí i s genealogiemi živých bytostí.
Výchozím bodem pro poznání fylogeneze organismů je stanovení jejich shod v záležitostech, jako je např DNA, morfologie, embryologie, molekuly DNA, mezi ostatními. Samozřejmě, pokud některý z nich poskytne pozitivní výsledek, pak můžeme mluvit o genetické příbuznosti a evoluční podobnosti.
Existují organismy, které jsou v evolučních záležitostech v úzkém vztahu s ostatními, protože například mohou sdílet společné předky, a právě tato otázka fylogeneze nebo fylogenetika, jak se také říká.
Nyní k provedení této relační studie je použita matrice molekul DNA. Z těchto údajů lze upřesnit fylogenetické stromy.
V díle přírodovědce Charles Darwin, Původ druhů, pocházející z poloviny devatenáctého století, se tento strom objevuje poprvé nakreslený, což nám říká tolik o evoluci živých organismů.
Mezitím tyto zmíněné genetické stromy tvoří základy, na kterých je založena fylogenetická klasifikace, což je typ vědecké klasifikace, která jedinečně zvažuje evolučně blízké vztahy mezi druhy, které obývají naši planetu. Rekonstruuje také historii toho, jak se diverzifikovaly, od doby, kdy se poprvé objevily na Zemi, až po současnost.
Například tyto informace, kromě toho, že jsou životně důležité, pokud jde o poznání druhu, vědět, proč má takové nebo jaké vlastnosti, jsou velmi obohacující, protože nám také umožňují s jistotou vědět, které druhy pocházejí od jiných, předčasná vymizení některé, jejich mutace, mimo jiné problémy.
Darwin byl nepochybně průkopníkem a jemu do značné míry vděčíme za touhu objevit evoluční historii druhů. Jeho návrh se jmenoval jako přírodní výběr byla to ta, která nejlépe vysvětlila biologickou evoluci. Podle jejich teorií budou podmínky prostředí klíčové, pokud jde o upřednostňování nebo brzdění vývoje druhu.
